El juego toma lugar en el planeta llamado Sera, el cual llegó a
tener una importante escasez de fuentes de energía. Durante una excavación fue
descubierta una sustancia fosforescente de baja viscosidad llamada Imulsión, la
cual por medio del proceso de Lightmass, descubierta por la Doctora Helen
Cooper, era convertida directamente en energía barata. Las naciones tuvieron un
gran problema económico. Esto llevó a que las naciones pelearan entre sí por el
control de la Imulsión, provocando la Guerra del Péndulo. La cual terminó en el
"Día de la Emergencia" El día en el que comenzó el ataque de los Locust fue
llamado el "día de la emergencia", debido a que Locust emergieron de la corteza
del planeta, donde habitan desde hace años. Ante este inesperado hecho, los
gobiernos de las naciones enfrentadas tuvieron que detener sus guerras, dejando
atrás los 70 años que duró la Guerra del Péndulo, para enfrentarse a esta nueva
amenaza para la humanidad que son los Locust. Pero fue demasiado tarde. Al ver
que la guerra directa era inútil, los humanos decidieron usar el láser de sus
satélites para eliminar sus propias ciudades. La mayor resistencia a estas
criaturas es el grupo llamado CGO (Coalición de Gobiernos Ordenados) y todos
sus diferentes escuadrones. Debido a las muchas bajas que se cobra la guerra,
gran cantidad de prisioneros están siendo enrolados en el ejército. Es el caso
del personaje principal de la historia, Marcus Fénix, que es sacado de la
cárcel por su amigo Dominic "Dom" Santiago.